朝内武将单列，文武平衡后，武将系统与皇帝的关系较好。因为武将系统新立，都是选择一些忠于皇帝的官吏，观念上就接近皇帝系统，皇帝系统的人员在武将系统内也占有很大的比例。武将需要皇帝的权力，才能与文官有对抗能力而不重回到文控制的局面。

总参谋部，总后勤部，总装备部的成立，是武将系统成立的标志，再加上由信王时期的训练处和宣导处发展扩大的训练部和宣导部，是武将系统的主要机构。武将系统虽然也是朝堂机构，但实质上支持皇帝。

皇帝系统的直属的军事部门主要是军事研究机构，是一些还没有划入武将系统的机构，或因新问题而成立的新办事机构。在秘书处之下也有训练部，宣导部，参谋部，后勤部，装备部的联络科室。

参谋部门是新成立的机构，也是重整军事的重要部门。中国古代有纸上谈兵的故事，对明朝影响很大的王阳明在掌军之前也熟读兵书，拿花生之类的实物来排兵布阵，是另一类纸上谈兵，其实，纸上谈兵达到一定的水平，纸上推演或与军事事务符合到一定的程度就是参谋学，参谋部是参谋学基础上的协助皇帝掌管军队和指挥军队的部门。

民用方面，对当时重点内容成立专门机构，如交通局和水运局。全国政治经济一体化，交通占有重要地位，原先有什么工程，都是工部在管，都是由工部布置地方人员完成工程。工部管理的工程漏洞就难说了，中间有没有贪污，贪污多少，都难查。地方的官员过手，肯定必贪，现在困难时期，肯定要严防地方贪污抽成。

交通局和水运局就是为了廉洁办事，由救灾招收的民工队负责工程，由交通局和水运局提供管理人员，由工部提供技术人员，带有以工代赈的性质，少花钱，多办事。

对一些有需要，又条件还不成熟的部门则成立处，如水利处，贸易处，民工处，屯田处，胥吏处，工矿处，粮食处，运输处，内务处，信息处等。

信息处是皇帝体系的重要部门，是重点发展的部门。信息处下设有人才，商情，民情，官情，匪情，吏情，军情，敌情，资料，奸情各科。

各部门分工合作，共同行事。

信息组是原先信王府时建立幕僚府的最早组织，信息组之初是为了寻找人才，所以人才科是信息处的最早工作内容或科目。期后，因贸易需要，商情科和民情科成立，商情和民情也成了必须了解的内容。当时的官僚对贸易卡索严重，官情科也相应增设。后来纤夫军成形，剿匪需要，匪情也成为信息处的内容。再后来，接任皇帝后，军情吏情自然增设为科目，因为知识的重要性，搜寻天下资料也是重要任务，资料科也设立。奸情科为争对内部反判的重大案件而特设。近段时间，奸情科要向反间和反特发展，重点争对后金的反间和情报渗透。

信息组扩大为信息情报处后，人员也分为多个层次，组织也多种类形，中心组织要求最高，边缘人员要求低，面对敌情、奸情、匪情等内容的关键情报人员还需受过特别训练，组织也特别严密。信息组也由一般的人才和经济情报发展到争对敌特的特殊情报部门。

信息情报处与锦衣卫和东厂有区别，东厂和锦衣卫有捕人的权力，信息情报处没有捕人的权力，只能提供情报。信息情报处将有向秘密警察或国安局发展方向发展趋势。

信息处的人员训练和事务需研究，军政民政事务也需要研究，研讨处是发展的重要因素。秘书处成为管理机构，后来发展了，人才处从秘书处独立出来，对内部的人事按排提出意见。而后，军民各部门按职责各行其事。

信息处的内部结构也有点象内阁六部，如人才信息对应吏部，军事信息对应兵部等。吏部主要按那年的功名，按资论背加上表现授官。信息处的人才科的信息则偏重于下端人才的能力掌握，如一些胥吏，武林人士，技术工匠，等人才，对包括官吏在内的人才的廉洁奉公，能力水平，为人表现进行分析，根据综合情况中来评价此人能否可用，或做如何处理。

到崇祯元年底，朱弘拥有皇帝的名份，特区经济发展良好，水利也恢复中，建立了金融货币体系，朝内建立了文武分班的体制，再以参谋部，后勤部，装备部等手段削弱文官系统的权力，限制或减少贪污事件，新式军队有所建立，军备有所提高，军校和各种学堂不断建立，武将系统与庶族力量有所发展，自己也有了一点威望和权力。