如今，石达开已经由军转政，成为福建省委主任。杨烜的心腹爱将李秀成，则接任步四师师长。

步四师后来居上，战斗力超过步三师。步三师在两广蛰伏多年，北上湖南后表现神勇，令全军刮目相看。步四师同样不遑多让，进入皖南后所向无敌，不论太平军、清军还是团练，统统败下阵来。

不出半个月，太平军败局已定，秦日纲直到这时仍未反应过来，企图死守徽州。徽州是座古城，城高墙厚，防御设施完善，秦日纲自以为可以固守一段时间。

李秀成擅长打巧战，战前都要做足谋划。他不按套路出牌，派人提前潜入徽州城内，诱降太平军将领。步四师与燕殿太平军都渊源于广西贵县来土械斗，骨干里有很多广西贵县人。

诱降之计很快奏效。步四师攻城时，城内太平军内应打开城门，革命军攻入城内。

秦日纲猝不及防，指挥太平军与革命军巷战。他麾下亲军久经战阵，战斗力非一般清军可比。太平军依托地形优势，与革命军逐街逐屋地战斗。

尤其是，秦日纲豢养了一批童子军，取名为忠勇小队，队员多为十六岁以下的少年，太平军术语为“牌尾”。这些牌尾从小受到拜上帝教蛊惑，相信自己有天父保佑，相信死后可以升入天堂，作战非常英勇，毫不惧死。

战至下午，秦日纲自知不敌，下令忠勇小队死守徽州，自己率队逃跑。

李秀成来到徽州前线，听说忠勇小队宁死不降，颇感骇异。他登上城楼，亲眼见到童子军冥顽不灵的样子，大惊失色，说道：

“秦日纲驱使童子兵卖命，让小孩做炮灰，实在是罪不可赦！”

眼见童子军弹尽援绝，李秀成下令劝降童子军。可这些太平军童子兵，久受拜上帝会蛊惑，并不相信革命军的话。他们从北门撤出，携手跳入护城河，却并不游动，而是打算溺亡于河中。

尽管死到临头，他们还念念有词，把拜上帝会的祷告词背得滚瓜烂熟：“敬拜天父，仰仗天威，交战胜利，恢复江山……”

李秀成见状，心如刀绞。青少年是国家的未来，太平军却拿他们当炮灰。若每个青少年都像太平军童子军那样被洗脑，中国还有希望吗？国家还能富强吗？

他下令赦免童子兵，给他们吃饭，令军医为他们疗伤。

革命军的善举大大出乎童子兵的意料。在拜上帝教的灌输下，革命军被描绘成不敬上帝、残暴成性的异教徒。可实际上，革命军文明有礼，以德报怨，让他们心智尚不成熟的童子兵深受感化。

他们自觉放弃了抵抗，亦不再寻死，反而眼含热泪，为守城时的凶残行径所懊悔。

李秀成留下少量人马占领徽州，教化太平军童子兵，随即率领骑兵追击秦日纲。太平军人马多，家眷也多，行军速度不快。在徽州府祁门县，步四师骑兵追上了太平军。

革命军一向优待俘虏，这次又号召“只诛首恶，不问胁从”，有效瓦解了太平军的抵抗意志。

祁门一战，太平军一触即溃，秦日纲带着少量亲兵战死，其他太平军或投降，或逃散为民。

至此，太平军彻底败亡，太平天国运动彻底结束。.